Пик оледенения снизил генетическое разнообразие древних людей
Основным «бутылочным горлышком», через которое прошло человечество, стали климатические факторы, а не выход из Африки. К такому выводу пришла команда исследователей из Швеции, Нидерландов, Испании и Румынии, изучив геном женщины эпохи верхнего палеолита.
Предполагается, что современные люди попали в Европу двумя путями: вдоль Средиземноморского побережья и по Дунаю. И действительно, останки Homo sapiens обнаружены в трёх пещерах в румынских Карпатах, все они старше 30 тысяч лет. В 1952 году в пещере Муйери (Peștera Muierilor) нашли череп женщины верхнего палеолита возрастом около 34 тысяч лет. Антропологи обратили внимание на некоторые неандертальские черты в его строении. Теперь же этот череп изучили палеогенетики. До сих пор в распоряжении исследователей было восемь древних геномов из четырёх мест старше 30 тысяч лет и прочитанных с хорошим качеством: один из Усть-Ишима (Иркутская область), один из Костенок (Воронежская область), два — со стоянки на реке Яна (Якутия) и четыре со стоянки Сунгирь (Владимирская область). Геном из Муйери стал девятым.
Для выделения ДНК из черепа женщины из пещеры Муйери генетики использовали четыре зуба, причём применили новый метод, позволивший получить из древнего материала в 33 раза больше ДНК, чем это удавалось сделать ранее. Геном секвенировали c очень высоким для древней ДНК покрытием (13,5х) — столько раз в среднем был прочитан каждый нуклеотид, что говорит о высокой надёжности результатов. Сравнение фрагментов, относящихся к Х-хромосоме и к прочим хромосомам, подтвердило предположение антропологов, что это женщина. Её митохондриальная ДНК принадлежала к гаплогруппе U6, типичной для верхнепалеолитических охотников-собирателей.
Анализ генома показал, что в нём содержится 3,1% неандертальской ДНК. Это примерно столько же, что и в прочих европейских геномах раннего верхнего палеолита. У современных людей неандертальский вклад в геном меньше, так как на многие заимствованные фрагменты действует отрицательный отбор. Интересно, что в геноме другого древнего индивида из Румынии — из пещеры Пе́штера-ку-Оа́се, возрастом 40 тысяч лет, было найдено 6—9% неандертальской ДНК, полученной всего за несколько поколений до его жизни. Это говорит о том, что, несмотря на территориальную и временнýю близость двух древних людей из румынских пещер, у них разная история смешения с неандертальцами.