Погребенные в 1410 километрах друг от друга афанасьевцы оказались родственниками
Узнать это помог новый инструмент анализа древних геномов
Генетики и биоинформатики из Германии и США представили новую программу ancIBD, с помощью которой можно выявлять общие по происхождению блоки в геномах древних людей. Благодаря этому инструменту они нашли двух дальних родственников среди носителей афанасьевской археологической культуры, которых около пяти тысяч лет назад похоронили на расстоянии 1410 километров друг от друга. Кроме того, они нашли прямые свидетельства существования недавних общих предков у представителей разных культур позднего энеолита и ранней бронзы, включая носителей ямной культуры и представителей культуры шнуровой керамики. Препринт этой работы выложен на сайте bioRxiv.
В последнее время в популяционной и исторической генетике уделяется все больше внимания исследованиям общих по происхождению блоков сцепления (identical by descent, IBD). Они представляют собой сегменты геномов с идентичными нуклеотидными последовательностями, которые два или более людей унаследовали от общего предка без рекомбинации. Длина этих общих по происхождению блоков зависит от того, сколько поколений прошло с того момента, когда жил общий предок исследованных людей. Так, в геномах близких родственников присутствуют идентичные по происхождению блоки, длина которых превышает 66,7 сантиморгана. У двоюродных родственников ожидаемая длина IBD превышает 62 сантиморгана, а у троюродных – 25.
Однако существующие методы изучения общих по происхождению блоков далеко не всегда подходят для исследования древних геномов. Дело в том, что из-за плохой сохранности ДНК в древних останках обычно качество прочтения генома остается низким (бывают и неожиданные исключения, например, сохранность ДНК в 64-тысячелетней фаланге из Денисовой пещеры позволила прочитать геном с 30-кратным покрытием). Кроме того, при работе с древней ДНК с высокой частотой происходят ошибки генотипирования.